Des chercheurs indiens mettent au point un outil miniature d'édition du génome des plantes
21 Août 2024 Publié dans #amélioration des plantes, #NGT, #CRISPR
ISAAA*
La technologie d'édition du génome a révolutionné l'agriculture, apportant des innovations prêtes à être commercialisées telles que le soja à haute teneur en acide oléique, les feuilles de moutarde à faible âcreté et les tomates à haute teneur en GABA. Le potentiel de cette technologie pour améliorer la durabilité de l'agriculture est immense.
Traditionnellement, la nucléase SpCas9, avec sa taille importante d'environ 1.350 acides aminés, a été l'outil le plus utilisé pour l'édition du génome. Toutefois, sa grande taille pose des problèmes importants, notamment pour l'acheminement efficace à l'intérieur des cellules, en particulier par le biais de vecteurs viraux. La réduction de la taille des nucléases d'édition du génome guidées par l'ARN est un objectif essentiel pour surmonter ces limitations. Des nucléases plus petites améliorent non seulement l'efficacité de l'administration, mais facilitent également la création de protéines de fusion, ce qui élargit le champ d'application de l'ingénierie du génome.
Dans une étude pionnière, des chercheurs de l'ICAR-National Rice Research Institute (NRRI), à Cuttack, ont mis au point un éditeur de génome végétal miniature dont la taille ne représente qu'un tiers de celle de la Cas9, largement utilisée. Cette nouvelle protéine d'édition du génome, dérivée de la protéine TnpB associée aux transposons de Deinococcus radiodurans, s'est avérée très efficace pour éditer de multiples gènes à la fois dans le riz, une monocotylédone, et dans Arabidopsis, une dicotylédone.
Comme Cas9, qui a besoin d'un motif adjacent au protospacer (PAM – protospacer adjacent motif) pour le ciblage, TnpB a besoin d'un motif associé au transposon (TAM – transposon-associated motif) adjacent à la séquence cible. TnpB peut cibler des régions uniques du génome que Cas9 ne peut pas cibler, ajoutant ainsi une nouvelle dimension aux capacités d'édition du génome.
L'étude, publiée dans le Plant Biotechnology Journal, présente la TnpB comme un outil hypercompact, polyvalent et prometteur pour l'ingénierie du génome des plantes, marquant ainsi une avancée significative dans ce domaine.
Lire l'article de recherche dans le Plant Biotechnology Journal.
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