L'édition de base de GhTFL1 crée une architecture idéale pour le cotonnier

L'édition de base de GhTFL₁ crée une architecture idéale pour le cotonnier

ISAAA*

Les éditeurs de base dérivés de CRISPR-Cas offrent une édition précise des gènes, permettant des avancées majeures dans la recherche fondamentale et l'amélioration des cultures. Cependant, leur efficacité reste variable d'un site cible à l'autre. Des scientifiques de l'Université Agricole de Huazhong et leurs partenaires ont mis au point des éditeurs de base très efficaces pour les plantes de cotonnier. La fusion de GhABE8e avec le nCas9 conventionnel a permis d'obtenir une efficacité d'édition de 99,9 % sans effets hors cible détectables. En outre, le remplacement de nCas9 par dCpf1 a élargi la gamme des sites cibles éditables.

Pour étudier la fonction de TERMINAL FLOWER 1 (TFL1), l'équipe a édité ses régions non codantes et codantes avec 26 cibles, générant ainsi 300 lignées de cotonnier indépendantes. Cela a révélé les rôles pléiotropiques de TFL1, permettant une domestication rapide et la création de plantes de cotonnier idéales : taille modérée avec des branches raccourcies, forme compacte et floraison précoce.

Les résultats de l'étude établissent une plate-forme et des données génétiques essentielles pour développer des cultures dotées d'une architecture végétale idéale.

Trouver d'autres résultats dans Genome Biology.

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* Source : Base Editing of GhTFL₁ Creates Ideal Cotton Plant Architecture- Crop Biotech Update (February 28, 2024) | Gene Editing Supplement - ISAAA.org

Ma note : Voici le résumé de « Precise fine-tuning of GhTFL₁ by base editing tools defines ideal cotton plant architecture » (L'ajustement précis de GhTFL₁ par des outils d'édition de base définit l'architecture idéale de la plante de cotonnier) de Guanying Wang, Fuqiu Wang, Zhongping Xu, Ying Wang, Can Zhang, Yi Zhou, Fengjiao Hui, Xiyan Yang, Xinhui Nie, Xianlong Zhang et Shuangxia Jin :

« Contexte

L'éditeur de base dérivé de CRISPR/Cas permet une édition précise des sites cibles et a été largement utilisé pour la recherche fondamentale et l'amélioration génétique des cultures. Cependant, l'efficacité d'édition des éditeurs de base sur différentes cibles varie considérablement.

Résultats

Nous avons développé ici un ensemble d'éditeurs de base très efficaces chez le cotonnier. GhABE8e, qui est fusionné au nCas9 conventionnel, présente une efficacité d'édition de 99,9 %, contre 64,9 % pour GhABE7.10, et aucune édition hors cible n'est détectée. Nous remplaçons en outre nCas9 par dCpf1, qui reconnaît les séquences TTTV PAM, afin d'élargir la portée du site cible. Pour explorer la divergence fonctionnelle de TERMINAL FLOWER 1 (TFL₁), nous éditons les régions codantes et non codantes de GhTFL₁ avec 26 cibles pour générer une population allélique complète comprenant 300 lignées indépendantes chez le cotonnier. Cela permet de révéler les rôles pléiotropiques cachés de GhTFL₁ et nous permet de réaliser rapidement la domestication dirigée du cotonnier et de créer un matériel génétique idéotype avec une hauteur modérée, des branches fructifères raccourcies, une plante compacte et une floraison précoce. En outre, en explorant le mécanisme moléculaire des mutations GhTFL₁^L86P et GhTFL₁^K53G+S78G, nous avons découvert que la mutation GhTFL₁^L86P affaiblit la force de liaison de GhTFL₁ à d'autres protéines, mais ne conduit pas à une perte complète de la fonction de GhTFL₁.

Conclusions

Cette stratégie fournit une plate-forme technique importante et des informations génétiques pour l'étude et la création d'une architecture végétale idéale. »